F i g u r e 2 C o n s e r v e d d o m a i n s b e t w e e n s t r u c t u r e p r o t e i n s a n d h u m a n h e m e b i n d i n g p r o t e i n s A C o n s e r v e d d o m a i n s o f s u r f a c e g l y c o p r o t e i n B C o n s e r v e d d o m a i n s o f e n v e l o p e p r o t e i n C C o n s e r v e d d o m a i n s o f m e m b r a n e g l y c o p r o t e i n D C o n s e r v e d d o m a i n s o f n u c l e o c a p s i d p h o s p h o p r o t e i n N e x t t h e S w i s s m o d e l o n l i n e s e r v e r m o d e l e d t h e s u r f a c e g l y c o p r o t e i n s t o p r o d u c e a t h r e e d i m e n s i o n a l s t r u c t u r e a n d t w o k i n d s o f f i l e s b a s e d o n t h e S p i k e a n d E 2 t e m p l a t e s w e r e s e l e c t e d T h e 3 D s t r u c t u r a l f i l e o f h e m e w a s d o w n l o a d e d f r o m t h e P D B d a t a b a s e I n t h e e n d D i s c o v e r y S t u d i o r e a l i z e d m o l e c u l a r d o c k i n g o f s u r f a c e g l y c o p r o t e i n s a n d t h e p o r p h y r i n T h e d o c k i n g o f t h e S p i k e p r o t e i n w i t h h e m e a n d p o r p h y r i n f a i l e d f i r s t E 2 g l y c o p r o t e i n F i g u r e 3 A i s d e r i v e d f r o m t e m p l a t e s 1 z v a 1 A T h e d o c k i n g o f E 2 g l y c o p r o t e i n a n d h e m e w a s a l s o f r u i t l e s s W h e n t h e i r o n i o n w a s r e m o v e d t h e h e m e b e c a m e a p o r p h y r i n m a n y k i n d s o f d o c k i n g w e r e f i n a l i z e d b e t w e e n t h e E 2 g l y c o p r o t e i n a n d t h e p o r p h y r i n C a l c u l a t i n g t h e b i n d i n g e n e r g y t h e d o c k i n g p o s e w i t h t h e h i g h e s t b i n d i n g e n e r g y 7 5 3 0 1 8 6 2 6 5 8 0 k c a l m o l w a s a c c e p t e d T h e d o c k i n g r e s u l t i s e x h i b i t e d i n F i g u r e 4 A 1 w h i c h i s t h e m o l e c u l a r m o d e l o f E 2 g l y c o p r o t e i n b i n d s t o t h e p o r p h y r i n