F i g u r e 8 C o n s e r v e d d o m a i n s b e t w e e n n o n s t r u c t u r e p r o t e i n s a n d h u m a n h e m e o x y g e n a s e p r o t e i n s A C o n s e r v e d d o m a i n s o f o r f 1 a b B C o n s e r v e d d o m a i n s o f O R F 3 a C C o n s e r v e d d o m a i n s o f O R F 6 D C o n s e r v e d d o m a i n s o f O R F 7 a E C o n s e r v e d d o m a i n s o f O R F 8 F C o n s e r v e d d o m a i n s o f O R F 1 0 3 3 V i r a l n o n s t r u c t u r a l p r o t e i n a t t a c k s t h e h e m e o n t h e b e t a c h a i n o f t h e h e m o g l o b i n P o r p h y r i n s i n t h e h u m a n b o d y a r e m o s t l y i r o n p o r p h y r i n s t h a t i s h e m e A n d a l o t o f h e m e i s n o t f r e e b u t b i n d t o h e m o g l o b i n T h e r e w a s a m a s s i v e d e m a n d o f p o r p h y r i n s f o r v i r u s e s t o s u r v i v e T h e r e f o r e t h e n o v e l c o r o n a v i r u s t a r g e t e d h e m o g l o b i n a t t a c k e d h e m e a n d h u n t e d p o r p h y r i n s T h e p r e v i o u s a n a l y s i s r e s u l t s s h o w e d t h a t O R F 1 a b O R F 3 a a n d O R F 1 0 h a v e d o m a i n s s i m i l a r t o h e m e o x y g e n a s e b u t o n l y O R F 1 a b c o u l d b i n d t o p o r p h y r i n T o s t u d y t h e a t t a c k b e h a v i o r o f o r f 1 a b O R F 3 a a n d O R F 1 0 p r o t e i n s w e u s e d t h e Z D O C K m o l e c u l a r d o c k i n g t e c h n o l o g y t o e x a m i n e t h e s e t h r e e p r o t e i n s Z D O C K m o l e c u l a r d o c k i n g t e c h n o l o g y c a n a n a l y z e p r o t e i n i n t e r a c t i o n s a n d f i n d t h e a p p r o x i m a t e p o s i t i o n s o f t h e s e t h r e e p r o t e i n s o n h e m o g l o b i n F i r s t w e d o w n l o a d e d h e m e o x y g e n a s e 2 5 U C 8 f r o m t h e P D B a n d u s e d i t a s a t e m p l a t e a n d t h e n u t i l i z e d t h e h o m o l o g y m o d e l i n g t o o l o f D i s c o v e r y S t u d i o t o g e n e r a t e t h e 3 D s t r u c t u r e o f O R F 1 0 F i g u r e 9 S i n c e h e m o g l o b i n h a s t w o f o r m s o f o x i d a t i o n a n d d e o x y g e n a t i o n t h e f o l l o w i n g a n a l y s i s a l s o p e r f o r m s p r o t e i n m o l e c u l a r d o c k i n g i n t h e s e t w o c a s e s t a k i n g t h e p o s t u r e w i t h t h e h i g h e s t Z D O C K s c o r e F i g u r e 9 h o m o l o g y m o d e l i n g o f O R F 1 0 F o r d e o x y h e m o g l o b i n o r f 1 a b p a r k e d i n t h e m i d d l e b o t t o m o f t h e 1 a l p h a a n d 2 a l p h a c h a i n n e a r t h e 2 a l p h a c h a i n F i g u r e 1 0 A O R F 3 a p a r k e d i n t h e m i d d l e b o t t o m o f t h e 1 a l p h a a n d 2 a l p h a c h a i n n e a r t h e 2 a l p h a c h a i n F i g u r e 1 0 B O R F 1 0 m o o r e d o n t h e m i d d l e b o t t o m o f t h e 1 b e t a a n d 2 b e t a c h a i n n e a r t h e 1 b e t a c h a i n F i g u r e 1 0 C T h e p o s s i b l e m e c h a n i s m w a s t h a t o r f 1 a b h i t t h e 2 a l p h a c h a i n c a u s i n g c o n f o r m a t i o n s c h a n g e s i n g l o b i n p r o t e i n O R F 3 A f o r c e d t o t h e 2 a l p h a c h a i n t o a t t a c k t h e 1 b e t a c h a i n a n d e x p o s e d i t s h e m e O R F 1 0 q u i c k l y a t t a c h e d t o t h e 1 b e t a c h a i n a n d d i r e c t l y i m p a c t e d t h e h e m e o f 1 b e t a c h a i n W h e n t h e i r o n a t o m d i s s o c i a t e d t h e h e m e c h a n g e d i n t o p o r p h y r i n a n d o r f 1 a b f i n a l l y c a p t u r e d p o r p h y r i n o r f 1 a b p l a y e d a v i t a l r o l e t h r o u g h o u t t h e a t t a c k