t h e O R F 8 p r o t e i n a n d t h e p o r p h y r i n C M o l e c u l a r d o c k i n g r e s u l t s o f t h e O R F 7 a p r o t e i n a n d t h e p o r p h y r i n 1 V i r a l n o n s t r u c t u r a l p r o t e i n s 2 V i e w o f t h e b i n d i n g s e c t i o n s F i n a l l y t h e f o l l o w i n g a n a l y s i s w a s p e r f o r m e d t o f i n d o u t w h e t h e r n o n s t r u c t u r a l p r o t e i n s a t t a c k e d t h e h e m e a n d d i s s o c i a t e d t h e i r o n a t o m t o f o r m p o r p h y r i n s H e r e t h e s a m e m e t h o d s a s p r e v i o u s s t r u c t u r a l p r o t e i n s M E M E s o n l i n e s e r v e r w e r e u s e d t o a n a l y z e t h e c o n s e r v e d d o m a i n s o f n o n s t r u c t u r a l p r o t e i n s a n d h e m e o x i d a s e p r o t e i n s N P 0 0 2 1 2 4 1 h e m e o x y g e n a s e 1 B A A 0 4 7 8 9 1 h e m e o x y g e n a s e 2 A A B 2 2 1 1 0 2 h e m e o x y g e n a s e 2 A s s h o w n i n F i g u r e 8 O R F 1 0 o r f 1 a b a n d O R F 3 a h a v e c o n s e r v e d d o m a i n s C o m b i n i n g t h e r e s u l t s o f t h e p r e v i o u s a n a l y s i s i t i s s h o w e d n o n s t r u c t u r a l p r o t e i n s O R F 1 0 o r f 1 a b a n d O R F 3 a c o u l d a t t a c k t h e h e m e a n d d i s s o c i a t e t h e i r o n a t o m t o f o r m t h e p o r p h y r i n H o w e v e r t h e p V a l u e o f o r f 1 a b a n d O R F 3 a i s g r e a t t h a n 0 1 T h e r e f o r e O R F 1 0 m a y b e t h e p r i m a r y p r o t e i n t o a t t a c k h e m e o r f 1 a b a n d O R F 3 a c a p t u r e t h e h e m e o r t h e p o r p h y r i n T h e r e s u l t s m a r k e d t h a t o r f 1 a b O R F 7 a a n d O R F 8 c o u l d b i n d t o t h e p o r p h y r i n w h i l e O R F 1 0 O R F 3 a a n d O R F 6 c o u l d n o t b i n d t o h e m e a n d p o r p h y r i n O R F 1 0 O R F 1 a b a n d O R F 3 a a l s o h a v e t h e a b i l i t y t o a t t a c k t h e h e m e t o f o r m a p o r p h y r i n T h e b i n d i n g e n e r g i e s o f o r f 1 a b O R F 7 a O R F 8 a n d t h e p o r p h y r i n w e r e c o m p a r e d r e s p e c t i v e l y I t w a s f o u n d t h e b i n d i n g e n e r g y o f O R F 7 a w a s t h e l o w e s t t h e b i n d i n g e n e r g y o f O R F 8 w a s t h e h i g h e s t a n d t h e b i n d i n g e n e r g y o f o r f 1 a b w a s m e d i u m T h i s m e a n s t h a t b i n d i n g O R F 8 t o t h e p o r p h y r i n i s t h e m o s t s t a b l e t h e b i n d i n g o f o r f 1 a b t o t h e p o r p h y r i n i s u n s t a b l e a n d b i n d i n g O R F 7 a t o t h e p o r p h y r i n i s t h e m o s t u n s t a b l e T h e s e q u e n c e s o f O R F 1 0 a n d O R F 6 a r e s h o r t s o t h e y s h o u l d b e s h o r t s i g n a l p e p t i d e s T h e r e f o r e t h e m e c h a n i s m b y w h i c h n o n s t r u c t u r a l p r o t e i n s a t t a c k h e m e m i g h t b e O R F 1 0 O R F 1 a b a n d O R F 3 a a t t a c k e d h e m e a n d g e n e r a t e d t h e p o r p h y r i n O R F 6 a n d O R F 7 a s e n t t h e p o r p h y r i n t o O R F 8 a n d O R F 8 a n d t h e p o r p h y r i n f o r m e d a s t a b l e c o m p l e x